【新撰組】
　対魔組織として姿を変え、誠の旗の下に人の世の未来を作ることを理念とする組織。ただし、国家公認のものではなく、自警団的な意味合いが強い。
　隊員たちはそれぞれ普段の仕事を持ち、いざという時にはだんだら羽織を身に纏う。
永倉 新八 [ながくら しんぱち]
　新撰組局長。老いてなお血気盛んな剣豪。
山南 極 [やまなみ きわめ]
　新撰組零番隊組長。飄々とした態度を崩さない氷の妖精使い。
池田屋 すずめ
　新撰組隊士。真面目でやる気はあるのだが、微妙に空回りしているドジっ子。

【天武八家】
九輝 光顕 [くき みつあき]
　九輝家当主。当主という要職にありながら冒険と浪漫を求める大陸浪人。
火神 暁 [かがみ さとる]
　火神家当主。豪快な性格の偉丈夫。粗暴なところもあるが、周囲の信頼は厚い。
流 [ながれ]
　水の当主。内外の事情に通じ、巧みに操っていく怪老。
伊綱 葵 [いづな あおい]
　伊綱家党首。ドレス姿を好むお嬢様。いつも強気で我が強い。
土方 菊乃 [ひじかた きくの]
　土方家当主。遊郭の女主人も勤めていて、裏社会の事情にも明るい。
御影 律 [みかげ じん]
　御影家当主。どこにでもいそうな印象の薄い男。調査任務に長ける。

【天老院】
鏡 稜三 [かがみ りょうぞう]
　御前様お側役。お側役の声を伝える役目だが、その特権を利用し権威の私有化を図っている。
鴉 [からす]
　天老院エージェント。黒のスーツを纏った生真面目な女性。
来栖 晶 [くるす あきら]
　天老院陰陽局構成員。戦闘力が高いがややエリート志向に偏っている青年。

【綾篠学園】
　広く門戸を開く教育機関であり、同時に異能使いの育成・修練も行っている。また、人間社会に出てきた妖怪が知識や常識を学ぶこともできる。
　女学校も存在し、大正時代では小袖に袴の制服からセーラー服の以降している最中である。
綾篠 糾兵衛 [あやしの きゅうべえ]
　綾篠学園学長。厳つい風貌をした大柄な老人。理解力はあり、学生の起こした騒動をフォローしてくれる。
氷室 涼子 [ひむろ りょうこ]
　氷室家当主。当主になったばかりで今ひとつ自覚に欠けるが、生来の優しさからさまざまな事件に巻き込まれる。
あんころ
　学園の中庭に住む黒猫。人語を解し、学園内外の妖怪や魔性に類する情報に明るい。

【少年見鬼隊】
　能力的に未発達な少年少女に異能使いとしての教育を行い、実践を兼ねて一流の異能使いのサポートを行う。
後藤 新平 [ごとう しんぺい]
　少年見鬼隊総長。好々爺然とした老人。卓越した先見の明は他の追随を許さない。
九輝 光宗 [くき みつむね]
　九輝家当主光顕の子。幻惑と結界を使いこなす才能ある少年。
夕塚 凪 [ゆうづか なぎ]
　少年見鬼隊の隊員。日本人形のような物静かな美少女。

【はなぞの喫茶】
　大通りから外れた場所にひっそりとある喫茶店。その実態は、帝都における妖怪たちが集まる拠点のひとつである。
すいれん
　喫茶店の女主人であり、東京における妖怪たちの元締め。和服に帽子とパラソルというちぐはぐな格好を好む。
ミツ
　信州からやってきた化け狐。現在ははなぞの喫茶の女給として働いている。
岩城 香夜 [いわしろ こうや]
　はなぞの喫茶の常連客。天狗の眷属であり、東の妖怪の中でも一目置かれる存在。

【うわばみ荘】
　古い下宿だが、生活能力に欠けたダメ人間の吹き溜まりのようになっている。また、なぜか時の著名人がふらりと尋ねてくることが多い。
玉井 その [たまい その]
　うわばみ荘管理人。どことなく幼い容姿の女性だが、その頭に生えた猫耳にはだれも突っ込まない。
ニ羽鶴 七尾 [ふたばづる ななお]
　うわばみ荘の2号室に住む女性。酒好き美少年好きの慢性的にダメな感じのお姉さん。
朱雀 [すざく]
　綾篠学園の教師。真面目で生徒思いの青年。記憶の一部を失っている。

【魔人】
加藤 保憲 [かとう やすのり]
　帝国陸軍大尉。当代最強の魔術師でもあり、帝都壊滅を画策する。
風間 仁凱 [かざま じんがい]
　風間家当主。仁に厚い当主であったが、魔の力に魅せられてさらなる力を求めてしまう。
俯瞰する者・リン [ふかんするもの・りん]
　傍観者にして観察者。時と空間の狭間にあって、世界を物語として理解する少女。

【その他】
伊藤 博文 [いとう ひろふみ]
　影の内閣総理大臣(自称)。夜族だが、不老ではないため、最近はボケが進んでいる。
榎本 せら [えのもと せら]
　古道具屋『憶妙堂』店主。力ある物品を気楽に売りつけ、後のフォローをしない困ったお姉さん。
ポォラリス
　帝都を騒がす怪盗。夜の帝都に舞う伊達男で、美術品や書物などを狙う。
原 敬 [はら たかし]
　内閣総理大臣。自身と未来の理想の為に政治活動とは別の活動を行っている。
H.P.L.
　文通サークルを主催するアメリカの作家。文通相手に対して、異能じみた洞察力に根ざした手紙を送ってくる。
平賀 阿陰朱侘院 [ひらが あいんしゅたいん]
　天災発明家。平賀源内の子孫であり、自分がアインシュタイン(存命)の生まれ変わりであると自称している変人。
徳田 信治 [とくだ しんじ]
　三流ゴシップ記事を得意とする新聞社の編集長。それとしらずに異能事件に関わっていることも多い。
轟 右京 [とどろき うきょう]
　現実主義の書生。異能力をみるたびに驚き失神する。
跡見 圭吾 [あとみ けいご]
　陸軍少尉。異能力は持っていないが、異能使いの立場を理解し、支援を行っている青年将校。
宮本 武蔵 [みやもと むさし]
　五輪書の精霊。著者である宮本武蔵の名を名乗ってはいるが、剣術家を思わせる容姿の少女である。
日々 雷音 [ひび らいおん]
　三越デパートの創業者の放蕩息子。望むものすべてを実現してしまう天才であり、そんな世界に飽きている。
平井 太郎 [ひらい たろう]
　様々な情報に通じる夜鳴き蕎麦屋。後の江戸川乱歩。
土御門 魂依 [つちみかど たまえ]
　陸軍憲兵。細かいことは気にしない気風のいいお姉さん。符術の達人でもある。
アニー・オークレイ
　アメリカの女優。ワイルド・ウエスト・ショーに出演し、ライフルの名手でもあるおばさん。
浅草十三怪 [あさくさじゅうさんかい]
　仮面の女流講談師。誰に語るでもない講談を行い、物語を盛り上げる。